Từ ngày 01/01/2026, các quy định về xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực phí và lệ phí đã có sự thay đổi lớn theo Nghị định 02/2026/NĐ-CP. Nhằm hỗ trợ Quý doanh nghiệp chủ động trong kế hoạch tài chính và đảm bảo thông quan hàng hóa thuận lợi, PCS Logistics xin cập nhật những hướng dẫn mới nhất về việc nộp lệ phí Hải quan như sau.

1. Các hành vi vi phạm và khung hình phạt cụ thể
Nghị định 02/2026/NĐ-CP phân định rõ mức phạt cho các nhóm hành vi sai phạm:
1.1. Hành vi vi phạm quy định về nộp phí, lệ phí của người nộp phí, lệ phí (Điều 17)
Đối với hành vi vi phạm nghĩa vụ nộp phí, lệ phí không kịp thời dẫn đến thiếu số tiền phải nộp, mức phạt được tính dựa trên số tiền chênh lệch vi phạm
Phạt cảnh cáo: Áp dụng nếu vi phạm nghĩa vụ nộp nhưng không dẫn đến thiếu số tiền phí, lệ phí phải nộp.
Phạt tiền đối với hành vi dẫn đến thiếu số tiền phải nộp:
|
Số tiền vi phạm (lệ phí thiếu) |
Mức phạt tiền đối với Doanh nghiệp (Tổ chức) |
|
Dưới 10.000.000 VNĐ |
Từ 1.000.000 VNĐ đến 2.000.000 VNĐ |
|
Từ 10.000.000 VNĐ đến dưới 30.000.000 VNĐ |
Từ 2.000.000 VNĐ đến 5.000.000 VNĐ |
|
Từ 30.000.000 VNĐ đến dưới 50.000.000 VNĐ |
Từ 5.000.000 VNĐ đến 7.500.000 VNĐ |
|
Từ 50.000.000 VNĐ đến dưới 100.000.000 VNĐ |
Từ 7.500.000 VNĐ đến 15.000.000 VNĐ |
|
Từ 100.000.000 VNĐ đến dưới 300.000.000 VNĐ |
Từ 15.000.000 VNĐ đến 40.000.000 VNĐ |
|
Từ 300.000.000 VNĐ trở lên |
Từ 40.000.000 VNĐ đến 50.000.000 VNĐ |
Lưu ý: Mức phạt tiền tối đa đối với tổ chức trong lĩnh vực phí, lệ phí là 100.000.000 đồng.
1.2. Hành vi vi phạm quy định về khai phí, lệ phí (Điều 16)
Áp dụng cho các sai sót trên tờ khai hoặc chậm trễ trong khâu làm thủ tục kê khai.
|
Hành vi vi phạm |
Mức phạt (VNĐ) |
|
Khai chậm thời hạn hoặc khai không đầy đủ các mục (Lần đầu) |
Phạt cảnh cáo |
|
Khai chậm thời hạn hoặc khai không đầy đủ các mục (Tái phạm) |
500.000đ – 1.000.000đ |
|
Không kê khai phí, lệ phí theo quy định |
3.000.000đ – 5.000.000đ |
1.3 Hành vi vi phạm quy định về miễn, giảm phí, lệ phí (Điều 11)
Áp dụng khi doanh nghiệp kê khai sai thông tin để được hưởng các ưu đãi miễn giảm.
|
Loại vi phạm |
Cách tính mức phạt |
|
Khai không đúng để được miễn, giảm |
Phạt 20% số tiền được miễn, giảm (Tối thiểu 500.000đ, tối đa 50.000.000đ) |
|
Miễn, giảm không đúng quy định |
Phạt theo mức tương tự Nhóm 1 (dao động từ 500.000đ đến 50.000.000đ tùy số tiền chênh lệch) |
2. Biện pháp khắc phục hậu quả bắt buộc
Ngoài việc nộp phạt theo các mức trên, doanh nghiệp vi phạm còn phải thực hiện:
-
Buộc nộp đủ số tiền phí, lệ phí còn thiếu vào ngân sách nhà nước.
-
Nộp tiền chậm nộp theo quy định của Luật Quản lý thuế.
-
Hoàn trả tiền cho người nộp nếu việc miễn, giảm được thực hiện sai quy định.
Việc nắm vững và tuân thủ các quy định về lệ phí không chỉ giúp doanh nghiệp tối ưu quy trình vận hành mà còn khẳng định uy tín với cơ quan quản lý. PCS Logistics khuyến khích Quý doanh nghiệp:
-
Rà soát lại quy trình thanh toán lệ phí hiện tại.
-
Nếu chọn nộp theo tháng, cần thiết lập hệ thống nhắc lịch thanh toán trước ngày 10 hàng tháng để đảm bảo không vi phạm Nghị định 02/2026/NĐ-CP.
3. Phương án nộp lệ phí cho Doanh nghiệp
Theo hướng dẫn từ cơ quan Hải quan, doanh nghiệp có thể lựa chọn 1 trong 2 phương án:
-
Phương án 1: Nộp lệ phí hải quan trực tiếp ngay tại thời điểm mở tờ khai.
-
Phương án 2: Đăng ký nộp tổng hợp theo tháng bằng công văn gửi Văn thư đơn vị Hải quan, thời hạn thanh toán là trước ngày mùng 10 hàng tháng.

Nếu Quý khách hàng có bất kỳ thắc mắc nào về thủ tục hải quan và tìm hiểu về dịch vụ vận chuyển Quốc tế, xin vui lòng liên hệ với đội ngũ PCS Logistics qua hotline 1900.545.428 hoặc email support@pcs-logistics.com để được hỗ trợ kịp thời.
Nguồn trích dẫn:
[1] Hướng dẫn nộp lệ phí từ Cục Hải quan Hải Phòng (KV03).
[2] Nghị định 02/2026/NĐ-CP về xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực phí và lệ phí.
[3] Danh mục Tài khoản - Kho bạc Nhà nước để nộp thuế và phí (Cập nhật mới nhất).
[4] Mẫu công văn đăng ký nộp phí Hải quan theo tháng.






