Cập nhật chi phí mở tờ khai hải quan theo quy định mới là bao nhiêu?

Khi thực hiện thủ tục hải quan, mỗi tờ khai được đăng ký đều đi kèm một khoản lệ phí bắt buộc theo quy định của Nhà nước. Dù giá trị không lớn, chi phí mở tờ khai hải quan lại là điều kiện cần để hồ sơ được hệ thống hải quan tiếp nhận và đưa vào quy trình xử lý. Trên thực tế, không ít doanh nghiệp vẫn nhầm lẫn khoản lệ phí này với thuế xuất nhập khẩu hoặc cho rằng chi phí sẽ thay đổi theo trị giá lô hàng và số dòng khai báo. Bài viết dưới đây PCS Logistics sẽ làm rõ các nội dung cốt lõi liên quan đến chi phí mở tờ khai hải quan theo quy định hiện hành

1. Chi phí mở tờ khai hải quan là gì?

Chi phí mở tờ khai hải quan là khoản lệ phí hải quan mà tổ chức, cá nhân phải nộp khi thực hiện đăng ký tờ khai hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu hoặc phương tiện vận tải theo quy định của pháp luật về hải quan.

Khoản chi phí này:

• Được thu theo tờ khai

• không phụ thuộc vào trị giá hàng hóa

• không thay đổi theo số lượng dòng hàng

Chi phí mở tờ khai hải quan là một phần trong tổng chi phí làm thủ tục hải quan, bên cạnh các khoản thuế xuất nhập khẩu, thuế giá trị gia tăng, thuế tiêu thụ đặc biệt hoặc các khoản phí phát sinh khác tùy từng trường hợp.

Tổng quan chi phí mở tờ khai hải quan theo quy định mới hiện nay

2. Mức chi phí mở tờ khai hải quan hiện hành

Theo quy định về phí và lệ phí trong lĩnh vực hải quan, mức thu lệ phí đối với tờ khai hải quan được áp dụng thống nhất trên toàn quốc.

Mức thu cơ bản: 20.000 VND cho mỗi tờ khai hải quan

Mức thu này áp dụng đối với:

• Tờ khai hải quan hàng hóa xuất khẩu

• Tờ khai hải quan hàng hóa nhập khẩu

• Tờ khai phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh

Khoản lệ phí này không phụ thuộc vào trị giá lô hàng, không phụ thuộc số lượng dòng hàng và không phân biệt doanh nghiệp lớn hay nhỏ.

3. Các khoản phí, lệ phí hải quan liên quan có thể phát sinh

Ngoài chi phí mở tờ khai hải quan, trong quá trình làm thủ tục, doanh nghiệp có thể gặp thêm một số khoản phí, lệ phí khác tùy từng trường hợp cụ thể.

- Phí kiểm tra, giám sát: 200.000 VND cho mỗi đơn trong trường hợp hàng hóa bị yêu cầu kiểm tra, giám sát hoặc tạm dừng làm thủ tục do nghi ngờ vi phạm quyền sở hữu trí tuệ.

- Phí hải quan đối với hàng hóa quá cảnh: 200.000 VND cho mỗi tờ khai quá cảnh.

- Phí phương tiện vận tải quá cảnh

• 200.000 VND cho mỗi phương tiện đối với phương tiện quá cảnh đường bộ.

• 500.000 VND cho mỗi phương tiện đối với phương tiện quá cảnh đường thủy.

Các khoản phí này không phải lúc nào cũng phát sinh, doanh nghiệp chỉ cần dự trù khi lô hàng hoặc phương tiện rơi vào đúng loại thủ tục tương ứng.

4. Chi phí mở tờ khai hải quan có phụ thuộc trị giá hàng hóa không?

Đây là thắc mắc rất phổ biến của doanh nghiệp, đặc biệt với những lô hàng có trị giá lớn hoặc phát sinh nhiều dòng hàng trên cùng một tờ khai. Trên thực tế, nhiều doanh nghiệp vẫn nhầm lẫn giữa lệ phí mở tờ khai hải quan và thuế xuất nhập khẩu, dẫn tới cách hiểu chưa chính xác về cách tính chi phí.

Theo quy định hiện hành, chi phí mở tờ khai hải quan không phụ thuộc vào trị giá hàng hóa. Cụ thể:

• Lệ phí được thu theo mức cố định trên mỗi tờ khai

• Không tính theo giá trị lô hàng

• Không thay đổi dù hàng hóa có giá trị nhỏ hay lớn

Điều này có nghĩa là, dù doanh nghiệp khai báo một lô hàng trị giá vài triệu đồng hay vài chục tỷ đồng, mức lệ phí mở tờ khai hải quan vẫn áp dụng như nhau cho mỗi tờ khai.

Việc nắm rõ nguyên tắc này giúp doanh nghiệp tránh nhầm lẫn khi dự toán chi phí, đồng thời phân biệt rõ lệ phí hải quan với các khoản thuế phát sinh theo trị giá hàng hóa trong quá trình xuất nhập khẩu.

Chi phí mở tờ khai hải quan không phụ thuộc theo  trị giá hàng hóa

5. Thời điểm nộp chi phí mở tờ khai hải quan

Theo quy định, lệ phí hải quan được nộp khi doanh nghiệp phát sinh và đăng ký tờ khai hải quan trên hệ thống của cơ quan hải quan. Đây là điều kiện cần để tờ khai được tiếp nhận chính thức và đưa vào quy trình kiểm tra, thông quan theo quy định.

Đối với các doanh nghiệp có tần suất khai báo cao, phát sinh nhiều tờ khai trong tháng, pháp luật cho phép áp dụng hình thức nộp lệ phí linh hoạt hơn, bao gồm:

• Nộp lệ phí theo từng lần phát sinh tờ khai, hoặc

• Đăng ký nộp lệ phí tổng hợp theo tháng theo hướng dẫn của cơ quan hải quan

6. Trường hợp được miễn chi phí mở tờ khai hải quan

Bên cạnh các trường hợp phải nộp lệ phí, pháp luật cũng quy định một số trường hợp được miễn chi phí mở tờ khai hải quan nhằm hỗ trợ các hoạt động mang tính đặc thù hoặc phục vụ mục tiêu xã hội, đối ngoại.

Các trường hợp thường gặp bao gồm:

• Hàng viện trợ nhân đạo, viện trợ không hoàn lại

• Hàng hóa thuộc diện miễn thuế theo quy định của pháp luật

• Hàng hóa mua bán, trao đổi của cư dân biên giới trong phạm vi định mức

• Các trường hợp được miễn theo điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên

Cần lưu ý rằng, việc miễn lệ phí chỉ được áp dụng khi doanh nghiệp đáp ứng đầy đủ điều kiện và hồ sơ theo quy định. Trước khi thực hiện, doanh nghiệp nên rà soát kỹ loại hình, chứng từ và hướng dẫn của cơ quan hải quan để tránh áp dụng sai, dẫn tới phải nộp bổ sung hoặc phát sinh xử lý vi phạm không đáng có.

7. Rủi ro khi không nộp chi phí mở tờ khai hải quan đúng quy định

Từ năm 2026, việc quản lý và xử phạt các hành vi vi phạm trong lĩnh vực phí và lệ phí được siết chặt hơn, trong đó có các nghĩa vụ liên quan đến lệ phí hải quan khi mở tờ khai. 

Doanh nghiệp có thể bị xử phạt nếu:

• Không nộp lệ phí hải quan đúng thời hạn

• Kê khai hoặc nộp thiếu lệ phí

• Nộp không đúng đối tượng, không đúng thẩm quyền

• Lợi dụng chính sách miễn, giảm lệ phí không đúng quy định

Rủi ro khi không nộp chi phí mở tờ khai hải quan đúng quy định

Những vi phạm này không chỉ làm phát sinh chi phí xử phạt mà còn ảnh hưởng trực tiếp đến hồ sơ tuân thủ và mức độ rủi ro trong quản lý hải quan của doanh nghiệp, từ đó tác động đến quá trình phân luồng, kiểm tra và thông quan trong các lần khai báo tiếp theo. 

Trong bối cảnh đó, doanh nghiệp cần chủ động cập nhật và tuân thủ đầy đủ các quy định mới về nộp lệ phí hải quan theo Nghị định 02/2026/NĐ-CP, nhằm hạn chế rủi ro pháp lý và đảm bảo hoạt động xuất nhập khẩu được vận hành ổn định.

8. Vì sao doanh nghiệp cần kiểm soát chi phí mở tờ khai hải quan?

Trong tổng thể chi phí xuất nhập khẩu, chi phí mở tờ khai hải quan là khoản có giá trị nhỏ. Tuy nhiên, đây lại là chỉ dấu quan trọng phản ánh mức độ tuân thủ thủ tục hải quan của doanh nghiệp trong quá trình khai báo và thông quan hàng hóa.

• Ảnh hưởng đến tiến độ tiếp nhận tờ khai

• Liên quan trực tiếp đến nghĩa vụ tài chính với cơ quan quản lý

• Tác động đến đánh giá rủi ro trong quá trình thông quan

Chi phí mở tờ khai hải quan là khoản lệ phí bắt buộc trong quá trình thực hiện thủ tục xuất nhập khẩu, tuy có giá trị không lớn nhưng lại gắn liền với nghĩa vụ tuân thủ và tiến độ xử lý hồ sơ hải quan của doanh nghiệp. Trong thực tế triển khai, doanh nghiệp nên kết hợp việc kiểm soát chi phí mở tờ khai hải quan với kế hoạch vận chuyển quốc tế phù hợp và quy trình khai báo rõ ràng để đảm bảo hoạt động xuất nhập khẩu được vận hành ổn định.

Trường hợp cần tư vấn cụ thể hơn về dịch vụ vận chuyển quốc tế hoặc các vấn đề liên quan đến mở tờ khai hải quan, doanh nghiệp có thể liên hệ PCS Logistics qua email support@pcs-logistics.com để được hỗ trợ và giải đáp theo nhu cầu thực tế.